bioconductorで遊ぼう

今日は助教、先輩方、留学生のＹさんとともに
テニスをしました。
初テニス、初コート、初ラケット。
ホームランがたくさんうてました(ToT)
。。。

さて今共同研究の関係でマイクロアレイ
解析をやってます。
Ｒ、バイオコンダクターの日々勉強。
最近おどろくのがバイオコンダクターの
ライブラリーの充実さ。
今日はgeneplotterのお勉強。

重要なプローブを染色体にマッピングした図が
ほしいときは

library(geneplotter)
library(mouse4302) #genechip information

#chromsome draw
chr <- buildChromLocation(mouse4302)
cPlot(chr)

#add color for important probe
imp_probe <- c("*****_at", "******_at")
cColor(imp_probe, "red", chr)

これっていろいろなマッピング図を描くのに
利用できそうv(^o^)v