パターンの種類

配列解析を行うにあたってパターン認識は重要課題のひとつ。
とある本によるとパターンは以下の3種類があるという。

"Solid pattern" : 文字列（DNAなら{ATGC}のみ）からなるパターン
"Rigid pattern" : 文字列＋ワイルドカード(N)からなるパターン、Solid patternに比べて
数が膨大になる可能性がある。
"Extensive pattern" : []や()でいくつかの候補を指定したり、位置特異性を指定したりする。
例えば、C..[FYWI]....C-(8,19)など

個人的な観点からするとExtensive patternはそんなに使わず、もっぱらSolidかRigidなパターン
を使用している。こういった概念はモチーフ探索の方法を考えるときなどに重要かも？？？
もうすぐこの果物がおいしくなる季節(*^o^*)

このときはまだ実ってなかったけど、近々スーパーにも顔見せするのでしょう。